《未来少年柯南》设定在西历2008年的未少地球。由于科学的年柯南过度发展，一场威力巨大的未少超磁力武器战争爆发，导致地轴弯曲和大规模的年柯南地壳运动，使得五大洲瞬间分崩离析，未少陆地下沉，年柯南几乎摧毁了地球的未少一半。二十年后，年柯南高立生活在仅存的未少小岛上，以为自己是年柯南世上唯一的幸存者，与年迈的未少爷爷相依为命。某天，年柯南他在海滩上救起了一名名叫罗拉的未少女孩，她具有与动物沟通的年柯南能力。罗拉的未少祖父是一名科学家，这一身份使野心家们垂涎三尺，他们试图通过罗拉进行威胁和控制。正当高立与罗拉逐渐建立友谊时，坏人们突然出现，杀害了高立的爷爷，并将罗拉带离小岛。面对失去亲人与朋友的挑战，高立决定踏上拯救罗拉的旅程。这不仅是一场冒险之旅，更是对生存希望的执着追求。在旅途中，高立不仅要克服各种困难和危险，还要揭开地球灾难背后的真相，最终找到重建家园的道路。